Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLN8Q9UBY8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN8Q9UBY8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms