Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
XCL2Q9UBD3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
XCL2Q9UBD3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms