Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL13Q9P2N7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms