Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO1Q9P1Z2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO1Q9P1Z2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms