Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCHIP1Q9P0W5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCHIP1Q9P0W5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms