Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVK5

FGFR1OP2, FGFR1 oncogene partner 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1OP2Q9NVK5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR1OP2Q9NVK5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR1OP2Q9NVK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms