Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC11Q9NVH1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms