Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMP3Q9NV31 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMP3Q9NV31 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMP3Q9NV31 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMP3Q9NV31 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMP3Q9NV31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMP3Q9NV31 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IMP3Q9NV31 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP3Q9NV31 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms