Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOMER3Q9NSC5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER3Q9NSC5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms