Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELLSQ9NRZ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELLSQ9NRZ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms