Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAPOLBQ9NRJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAPOLBQ9NRJ5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms