Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEPEQ9NQ76 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEPEQ9NQ76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms