Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX9Q9NQ69 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LHX9Q9NQ69 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms