Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CWC22Q9HCG8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CWC22Q9HCG8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms