Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC4Q9HBW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.9 ms