Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASSF4Q9H2L5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASSF4Q9H2L5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms