Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCL3Q9H2J4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms