Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR3FQ9H1D9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR3FQ9H1D9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms