Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZCCHC2Q9C0B9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms