Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms