Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LGR4Q9BXB1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGR4Q9BXB1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms