Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL3Q9BXA9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL3Q9BXA9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms