Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf50Q9BV19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms