Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGME1Q9BQP7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MGME1Q9BQP7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGME1Q9BQP7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms