Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPIN3Q9BQK8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LPIN3Q9BQK8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LPIN3Q9BQK8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms