Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNS3Q9BQ31 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNS3Q9BQ31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms