Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBBP8Q99708 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 847 ms