Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UHRF1Q96T88 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UHRF1Q96T88 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
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