Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUFY1Q96T51 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY1Q96T51 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY1Q96T51 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms