Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBL7Q96S82 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBL7Q96S82 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBL7Q96S82 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBL7Q96S82 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
UBL7Q96S82 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBL7Q96S82 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBL7Q96S82 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UBL7Q96S82 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBL7Q96S82 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms