Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPATA13Q96N96 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA13Q96N96 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms