Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ROBO3Q96MS0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ROBO3Q96MS0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms