Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM20AQ96MK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM20AQ96MK3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms