Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJD4Q96KN9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD4Q96KN9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJD4Q96KN9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJD4Q96KN9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms