Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPGRIP1Q96KN7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms