Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MS4A4AQ96JQ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A4AQ96JQ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms