Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCED1BQ96HM7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms