Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED8Q96G25 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MED8Q96G25 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED8Q96G25 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms