Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM11Q96F44 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM11Q96F44 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms