Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLCD1Q96CP7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLCD1Q96CP7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLCD1Q96CP7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms