Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN9Q8WX39 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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LCN9Q8WX39 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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LCN9Q8WX39 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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LCN9Q8WX39 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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LCN9Q8WX39 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN9Q8WX39 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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