Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCFD1Q8WVM8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCFD1Q8WVM8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms