Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELQQ8TDG4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELQQ8TDG4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms