Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HJURPQ8NCD3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HJURPQ8NCD3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms