Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CCDC155Q8N6L0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC155Q8N6L0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms