Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPATA24Q86W54 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPATA24Q86W54 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms