Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD163Q86VB7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD163Q86VB7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms