Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms