Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF39Q86UA1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF39Q86UA1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF39Q86UA1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms