Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT25Q7Z3Z0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT25Q7Z3Z0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms